62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0292 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  430  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  36.6 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  39.36 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  38.59 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  32.97 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  36.57 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  30.65 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  33.79 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  33.54 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  34.51 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 499 aa  78.2  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  35.21 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.86 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  32.62 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  30.14 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  27.41 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  32.61 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  36.63 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  36.46 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  32.08 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  32.69 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  29.7 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  29.08 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  26.97 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  25.64 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  25.68 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  24.87 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  26.55 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  25 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  27.63 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  28.04 
 
 		 477 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  26.42 
 
 		 394 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  26.42 
 
 		 394 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  25.47 
 
 		 394 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  25.47 
 
 		 394 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 702 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 702 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 647 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  33 
 
 		 645 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  27.52 
 
 		 546 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 647 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 		 723 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 657 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  27.88 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  27.62 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  30 
 
 		 636 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  31 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.45 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  28.81 
 
 		 434 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 631 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  34.82 
 
 		 128 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>