261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0200 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  100 
 
 		 394 aa  803    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  60 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.41 
 
 		 405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.08 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.05 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  40.73 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.7 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.48 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  36.99 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.97 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  37.14 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  36.45 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  37.03 
 
 		 1117 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  37.34 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  36.27 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.1 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  34.76 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  35.45 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  33.42 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  32.24 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  34.03 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  31.88 
 
 		 371 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  29.77 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  28.61 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  26.9 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.65 
 
 		 840 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.51 
 
 		 850 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  26.25 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.07 
 
 		 850 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.64 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.42 
 
 		 843 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.8 
 
 		 851 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.49 
 
 		 849 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.07 
 
 		 850 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  26.98 
 
 		 850 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  23.72 
 
 		 783 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  25.12 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.17 
 
 		 842 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  22.2 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.71 
 
 		 822 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  23.12 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.3 
 
 		 844 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25.2 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  24.62 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  25.61 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  24.05 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  21.96 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.04 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  21.96 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.24 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  23.82 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.91 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.14 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  29.86 
 
 		 504 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  23.96 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.61 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.88 
 
 		 512 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.13 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.81 
 
 		 844 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  25.47 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.87 
 
 		 849 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  25.61 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  25.45 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  21.46 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.81 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  22.44 
 
 		 428 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  23.46 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.98 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  24.37 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  21.31 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  24.67 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 885 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  25 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  22.8 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  24.53 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.18 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  23.35 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  25 
 
 		 489 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  25 
 
 		 487 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  24.16 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.58 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.31 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  22.53 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  23.3 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  23.92 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.3 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  21.46 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.81 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  22.59 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  22.2 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  22.42 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  20.42 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  23.19 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  22.61 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>