More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0177 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
329 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  50.16 
 
 
333 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  49.69 
 
 
331 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  48 
 
 
333 aa  316  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  47.72 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 
330 aa  298  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
368 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  44.24 
 
 
333 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  47.68 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  44.24 
 
 
333 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  43.47 
 
 
332 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 
332 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
350 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 
336 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
381 aa  285  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  47.94 
 
 
345 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  48.82 
 
 
344 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 
344 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  46.03 
 
 
341 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
877 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
342 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
404 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  42.95 
 
 
332 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
439 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
404 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
441 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
331 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  46.03 
 
 
429 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
387 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
353 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
353 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  45.7 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
332 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  41.87 
 
 
344 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 
332 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
331 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  45.03 
 
 
406 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  42.5 
 
 
377 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  45.03 
 
 
352 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
353 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  45.03 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
339 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  43.71 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 
348 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  43.81 
 
 
355 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  39.63 
 
 
343 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
340 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
346 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
336 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  42.81 
 
 
334 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
330 aa  235  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.76 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.07 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  28.8 
 
 
270 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.48 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  28.03 
 
 
270 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 
270 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.88 
 
 
270 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  36.99 
 
 
518 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 
270 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 
270 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.52 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
295 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.52 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
298 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  32.5 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  29.1 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>