More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0095 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  57.69 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.76 
 
 
392 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 
379 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.86 
 
 
398 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  44.34 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.86 
 
 
386 aa  87.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.86 
 
 
395 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.66 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.05 
 
 
390 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  38.68 
 
 
390 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
392 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.68 
 
 
390 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  45.26 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 
386 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.32 
 
 
386 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.86 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.85 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.24 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  36.79 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.79 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.39 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.29 
 
 
393 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
269 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  40.7 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.3 
 
 
566 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  46.84 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  41.07 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  41.07 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.19 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.54 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  36.19 
 
 
389 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.71 
 
 
566 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.43 
 
 
392 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.95 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
393 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.67 
 
 
484 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.67 
 
 
478 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  41.67 
 
 
478 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.67 
 
 
478 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.67 
 
 
484 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  42.39 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  37.17 
 
 
391 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  37.5 
 
 
423 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19210  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.58 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0193434  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 
460 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  39.53 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.85 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.51 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.51 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  35.64 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.51 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.48 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.98 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  38.37 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.58 
 
 
478 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.14 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.84 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.19 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
383 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
392 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 
271 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  36.61 
 
 
390 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.74 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
399 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
392 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>