More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0046 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
368 aa  747    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  58.97 
 
 
365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  58.94 
 
 
367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  57.1 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  56.66 
 
 
367 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  53.33 
 
 
360 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  54.7 
 
 
357 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  52.63 
 
 
363 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  50.43 
 
 
366 aa  360  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  53.85 
 
 
368 aa  358  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.56 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  49.44 
 
 
361 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  49.58 
 
 
376 aa  352  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.72 
 
 
356 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  48.16 
 
 
353 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  48.47 
 
 
353 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.96 
 
 
367 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.72 
 
 
372 aa  346  4e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  48.74 
 
 
376 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  45.2 
 
 
353 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  47.89 
 
 
373 aa  332  9e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  48.58 
 
 
356 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  50.6 
 
 
356 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  47.9 
 
 
359 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  46.65 
 
 
367 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  48.29 
 
 
356 aa  318  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  47.16 
 
 
364 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  45.22 
 
 
367 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  44.63 
 
 
371 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  46.05 
 
 
370 aa  293  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  44.86 
 
 
349 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  42.44 
 
 
364 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.34 
 
 
363 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.92 
 
 
305 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.77 
 
 
298 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  42.82 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  41.05 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.21 
 
 
362 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  41.76 
 
 
347 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  41.93 
 
 
363 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.59 
 
 
363 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  41.53 
 
 
356 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  41.53 
 
 
357 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.11 
 
 
382 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  41.55 
 
 
360 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  42.17 
 
 
355 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  40.68 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  40.64 
 
 
384 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  42.52 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  42.45 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  42.47 
 
 
361 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.19 
 
 
358 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.19 
 
 
358 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  42.82 
 
 
363 aa  272  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  41.79 
 
 
357 aa  271  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.83 
 
 
357 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  44.44 
 
 
374 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  45.3 
 
 
361 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  41.64 
 
 
361 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  39.95 
 
 
379 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  45.3 
 
 
361 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  41.64 
 
 
367 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  44.21 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  45.04 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  42.21 
 
 
363 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  42.49 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  44.54 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
348 aa  269  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  42.33 
 
 
358 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.91 
 
 
363 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  41.6 
 
 
363 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  41.67 
 
 
363 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  42.66 
 
 
362 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  41.6 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  38.83 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.21 
 
 
362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.38 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  45.48 
 
 
361 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  40.71 
 
 
388 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  38.58 
 
 
394 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  41.36 
 
 
358 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  39.94 
 
 
365 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  41.76 
 
 
363 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  40.8 
 
 
358 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  45.17 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  41.71 
 
 
345 aa  262  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  43.06 
 
 
363 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  38.17 
 
 
389 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  42.21 
 
 
364 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.02 
 
 
362 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  39.44 
 
 
364 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  43.63 
 
 
362 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  41.5 
 
 
363 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
354 aa  260  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  42.44 
 
 
363 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  43.87 
 
 
349 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  40.17 
 
 
364 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  41.34 
 
 
365 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.66 
 
 
371 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  42.21 
 
 
362 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>