More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0030 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 		 697 aa  710    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  57.16 
 
 		 673 aa  681    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.22 
 
 		 685 aa  832    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.1 
 
 		 641 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.17 
 
 		 697 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.82 
 
 		 676 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  56.73 
 
 		 691 aa  704    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 696 aa  1427    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  63.2 
 
 		 691 aa  794    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.62 
 
 		 673 aa  865    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.76 
 
 		 652 aa  677    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  63.27 
 
 		 692 aa  833    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  61.45 
 
 		 699 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 		 694 aa  622  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  52.4 
 
 		 706 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.7 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  52.55 
 
 		 817 aa  618  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  51.98 
 
 		 694 aa  618  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  50.32 
 
 		 648 aa  610  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 		 686 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  47.08 
 
 		 883 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  46.88 
 
 		 787 aa  594  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  65.73 
 
 		 476 aa  590  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 		 647 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  60.34 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  46.49 
 
 		 867 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 		 696 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 		 714 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  53.57 
 
 		 646 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 		 607 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  46.99 
 
 		 627 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.77 
 
 		 663 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.77 
 
 		 663 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  48.12 
 
 		 635 aa  551  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.58 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 639 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.44 
 
 		 615 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.6 
 
 		 706 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  52.47 
 
 		 692 aa  535  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  54.72 
 
 		 608 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.19 
 
 		 652 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.45 
 
 		 643 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  44.97 
 
 		 630 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  54.16 
 
 		 659 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 		 676 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.35 
 
 		 614 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  51.75 
 
 		 628 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.2 
 
 		 637 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  54.33 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 		 635 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  53 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 		 687 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 		 658 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 		 602 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  47.09 
 
 		 616 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 		 852 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  47.28 
 
 		 917 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 		 630 aa  525  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 		 676 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.17 
 
 		 662 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.87 
 
 		 655 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.75 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.25 
 
 		 628 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.46 
 
 		 628 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.18 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.19 
 
 		 673 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 		 621 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.69 
 
 		 621 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.58 
 
 		 631 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 		 612 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.45 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 		 612 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.84 
 
 		 653 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.28 
 
 		 655 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.04 
 
 		 621 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  51.49 
 
 		 641 aa  522  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 		 623 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  55.41 
 
 		 633 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  52.44 
 
 		 627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  55.2 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  55.2 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  55.2 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  52.85 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.07 
 
 		 635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 		 638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.36 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  55.2 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>