More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0014 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
346 aa  703    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  58.33 
 
 
350 aa  438  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  56.14 
 
 
348 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  56.77 
 
 
352 aa  424  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  56.18 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  54.49 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  54.6 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  53.37 
 
 
346 aa  378  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  52.66 
 
 
339 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  51.04 
 
 
339 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  44.89 
 
 
369 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 
358 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 
355 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  44.62 
 
 
354 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  43.25 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  40.65 
 
 
363 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  40.57 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  44.68 
 
 
354 aa  237  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.96 
 
 
339 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 
337 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.19 
 
 
331 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 
334 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 
327 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.02 
 
 
337 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 
324 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35 
 
 
334 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.78 
 
 
323 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  33.91 
 
 
329 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.99 
 
 
333 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.94 
 
 
328 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 
338 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 
318 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.14 
 
 
318 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  32.05 
 
 
318 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 
340 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.79 
 
 
323 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
317 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.43 
 
 
306 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 
323 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 
329 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  31.44 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  32.87 
 
 
316 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  31.43 
 
 
336 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 
320 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.94 
 
 
327 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  30.36 
 
 
318 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  35.64 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 
344 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.08 
 
 
318 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  38.75 
 
 
372 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
323 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.38 
 
 
346 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.91 
 
 
333 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.27 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  30.16 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  29.34 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.03 
 
 
332 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  30.34 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
336 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.84 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  30.38 
 
 
329 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  30.38 
 
 
329 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  31.49 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.03 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  30.38 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  29.71 
 
 
336 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
323 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
343 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.45 
 
 
318 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 
324 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  29.15 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  31.97 
 
 
327 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  30.97 
 
 
326 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  31.15 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  29.49 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  28.74 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  28.74 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  33.57 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.68 
 
 
318 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  31.36 
 
 
325 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  31.56 
 
 
315 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  31.36 
 
 
325 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 
325 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  31.36 
 
 
325 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  31.36 
 
 
325 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  31.36 
 
 
325 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  31.07 
 
 
325 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>