82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5693 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5693  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 423 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15360  family 3 adenylate cyclase  27.81 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.93 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 675 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 1172 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 1153 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.74 
 
 		 658 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.61 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.48 
 
 		 1081 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.27 
 
 		 1122 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.33 
 
 		 1080 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  22.76 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  23.77 
 
 		 1156 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.2 
 
 		 584 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 1180 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 		 1089 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  28.86 
 
 		 717 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.29 
 
 		 584 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.67 
 
 		 635 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 1094 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  23.28 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 681 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 607 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  24.24 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.37 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.53 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.82 
 
 		 528 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 735 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 		 574 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 524 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  28.99 
 
 		 636 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  23 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  22.15 
 
 		 1207 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.82 
 
 		 864 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.03 
 
 		 805 aa  46.6  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  27.74 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.14 
 
 		 1149 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  30.34 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  27.74 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.35 
 
 		 611 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1138 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1151 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1151 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1148 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  21.79 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  23.33 
 
 		 1204 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  24.34 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.79 
 
 		 1014 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  30 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.7 
 
 		 797 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  23.68 
 
 		 546 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.18 
 
 		 701 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 1142 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  21.79 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.93 
 
 		 643 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 701 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  24.78 
 
 		 684 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.6 
 
 		 524 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.83 
 
 		 1141 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  30.13 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.52 
 
 		 1291 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 		 665 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.68 
 
 		 1226 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  24.52 
 
 		 1048 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.71 
 
 		 575 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  26.35 
 
 		 577 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>