89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5680 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1078    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  54.56 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  40.52 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  39.22 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  50.22 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  36.36 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 3301 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 774 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  29.46 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 392 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.36 
 
 		 1644 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.36 
 
 		 1644 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 791 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 856 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 374 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  28.89 
 
 		 373 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 725 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 1386 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 1044 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 1233 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 1267 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 		 759 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 995 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 1267 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 364 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 389 aa  47.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  24.71 
 
 		 351 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 838 aa  47.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  35.07 
 
 		 787 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 376 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  27.57 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  31.86 
 
 		 383 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 1089 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 367 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  35.94 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 1039 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 370 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0893  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.021774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 831 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 359 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 624 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1745  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 358 aa  44.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06720  glycosyltransferase  40.82 
 
 		 398 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0367978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 401 aa  43.9  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1455  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 333 aa  43.9  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.862393  hitchhiker  0.0000873502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 383 aa  43.9  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 402 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1447  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 338 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000198609 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 394 aa  43.5  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  26.29 
 
 		 513 aa  43.5  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>