More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5631 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 341 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  81.47 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  79.77 
 
 		 347 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  80.29 
 
 		 347 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  80.35 
 
 		 347 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  79.77 
 
 		 347 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  71.93 
 
 		 346 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  71.64 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  68.24 
 
 		 344 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  67.65 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  56.6 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  55 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  57.02 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  55.13 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  57.43 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  56.56 
 
 		 345 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  55.98 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  52.02 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  53.62 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  49.41 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  49.41 
 
 		 344 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  50.58 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  50.87 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  48.85 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  51.18 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  48.82 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  47.35 
 
 		 342 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  46.11 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  46.11 
 
 		 346 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.25 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  44.12 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  42.69 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  44.28 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  43.57 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  42.37 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 340 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  40.23 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  42.09 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  42.32 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  39.53 
 
 		 582 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  40.23 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  41.64 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  42.2 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.2 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  39.6 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  41.91 
 
 		 340 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  41.16 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  41.33 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  41.16 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  41.16 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  40.87 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  40.87 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  37.65 
 
 		 577 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  40.7 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  40.29 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  40.41 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.74 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  36.88 
 
 		 407 aa  185  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  41.52 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  34.88 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  36.5 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.97 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  37.34 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  40.17 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  41.76 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  31.79 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  32.72 
 
 		 347 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  40.91 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.32 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  33.55 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.83 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.43 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  29.41 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.71 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  34.75 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  35.37 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.85 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>