More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5625 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  92.26 
 
 		 478 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  89.01 
 
 		 474 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  91.84 
 
 		 485 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  90.72 
 
 		 474 aa  879    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  90.93 
 
 		 474 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  968    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  92.89 
 
 		 485 aa  911    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  89.87 
 
 		 474 aa  864    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  65.04 
 
 		 475 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  90.08 
 
 		 474 aa  865    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  92.05 
 
 		 478 aa  903    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  61.57 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  64.81 
 
 		 560 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  61.99 
 
 		 476 aa  578  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  63.87 
 
 		 571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  63.5 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  60.43 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  63.87 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  59.44 
 
 		 485 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  60.26 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  58.66 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  62.61 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  62.53 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  59.91 
 
 		 479 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  59.74 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  60.26 
 
 		 475 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  60.26 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  60.21 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  61.49 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 468 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  57.58 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  57.42 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  57.36 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  60.17 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  59.52 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  60.39 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  63.42 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  58.92 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  60.86 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  61.74 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  61.74 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  58.62 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  60.48 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  58.01 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  59.87 
 
 		 475 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  62.03 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  57.36 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  60.69 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  60.94 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  58.06 
 
 		 481 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  58.53 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  58.53 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  58.1 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  59.61 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  60.39 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 478 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  58.41 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  55.27 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  56.93 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  58.55 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 		 468 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  56.22 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  58.44 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  58.44 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  57.67 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  58.79 
 
 		 540 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  53.7 
 
 		 475 aa  507  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  56.4 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  56.28 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  56.81 
 
 		 521 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  56.68 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  57.67 
 
 		 478 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  57.45 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  57.45 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  57.45 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  58.1 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  58.37 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  57.45 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  57.45 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  52.45 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  52.45 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  57.97 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  52.45 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3407  aspartate ammonia-lyase  58.12 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  54.97 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>