93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5596 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  77.88 
 
 
518 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  68.08 
 
 
520 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  74.23 
 
 
518 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  84.23 
 
 
518 aa  884    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  100 
 
 
520 aa  1054    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  30.1 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  29.19 
 
 
789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  27.68 
 
 
790 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  29.05 
 
 
480 aa  136  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  26.67 
 
 
524 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  23.35 
 
 
469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  22.67 
 
 
533 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  25.1 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  25.89 
 
 
523 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  26.15 
 
 
528 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  25.84 
 
 
530 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  20.93 
 
 
469 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  23.06 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  26.95 
 
 
527 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.71 
 
 
474 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  25.31 
 
 
534 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.87 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  23.12 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  26.08 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  25.86 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  28.47 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  24.18 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  24.77 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  29.26 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  24.18 
 
 
533 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  24.18 
 
 
533 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  26.3 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  25.76 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  24.89 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  37.7 
 
 
627 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  37.7 
 
 
642 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  37.7 
 
 
630 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  37.7 
 
 
653 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  37.7 
 
 
623 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  37.7 
 
 
635 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  37.7 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  26.02 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  37.5 
 
 
598 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  23.52 
 
 
470 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  23.52 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.88 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.93 
 
 
373 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.93 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.93 
 
 
369 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.85 
 
 
373 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  22.03 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.85 
 
 
373 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.67 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  22.03 
 
 
462 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  22.74 
 
 
470 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  27.67 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  30.22 
 
 
365 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  27.67 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  22.38 
 
 
437 aa  63.9  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  32.48 
 
 
337 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.04 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  33.01 
 
 
357 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  23.86 
 
 
434 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  27.04 
 
 
373 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.31 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.33 
 
 
439 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.08 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.06 
 
 
365 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  29.63 
 
 
791 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  31.06 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  31.06 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  32.35 
 
 
342 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  26.62 
 
 
366 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  28.21 
 
 
477 aa  50.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  27.07 
 
 
364 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.97 
 
 
366 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  29.63 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  28.8 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  28.1 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  25.64 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  29.63 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.52 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  25.64 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  31.37 
 
 
341 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  21.13 
 
 
458 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  23.33 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  23.33 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  28.7 
 
 
455 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>