49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5593 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  92.59 
 
 		 135 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  88.89 
 
 		 135 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  81.48 
 
 		 135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  78.52 
 
 		 142 aa  215  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  48.15 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  34.75 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  35.59 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  34.58 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  34.58 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  32.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  32.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  31.62 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  31.78 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  29.69 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  31.34 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.41 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.64 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  28.91 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.23 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.07 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  33.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  27.48 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  33.64 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  33.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.42 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  32.73 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.35 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.48 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  26.32 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0158  hypothetical protein  31.52 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>