70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5592 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  100 
 
 		 469 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  55.71 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  87.76 
 
 		 174 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  71.13 
 
 		 172 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  67.92 
 
 		 165 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  59.82 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  67.65 
 
 		 131 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  65.26 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3930  hypothetical protein  27.38 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  65.56 
 
 		 181 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  66.04 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  50.88 
 
 		 185 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3257  hypothetical protein  24.4 
 
 		 550 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.728074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  47.56 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  46.34 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  47.13 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 96 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  41.96 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  51.92 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  51.92 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  51.92 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  40.43 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  42.59 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  45.9 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 96 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 87 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 100 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  48.08 
 
 		 88 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.22 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  44.07 
 
 		 86 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  36.46 
 
 		 99 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 100 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  37.76 
 
 		 99 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  39.56 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  46.3 
 
 		 88 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 96 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  37.11 
 
 		 98 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 99 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 85 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  45.24 
 
 		 96 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 85 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39 
 
 		 102 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 88 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 96 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  44.62 
 
 		 118 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  46.55 
 
 		 89 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  40.22 
 
 		 91 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 86 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  41.11 
 
 		 88 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  40.22 
 
 		 91 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  47.17 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 96 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 96 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  40.22 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  40.22 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  55.36 
 
 		 94 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  38.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  36.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  40.62 
 
 		 855 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 96 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 94 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>