More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5576 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  90.08 
 
 
242 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  76.86 
 
 
242 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  76.45 
 
 
242 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  70.42 
 
 
242 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  46.84 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  45.57 
 
 
242 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.83 
 
 
243 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  45.64 
 
 
256 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  44.26 
 
 
256 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  44.49 
 
 
259 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  45.96 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  45.53 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.99 
 
 
239 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
255 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  37.97 
 
 
264 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  36.28 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
262 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  41.38 
 
 
421 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  38.15 
 
 
417 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  34.62 
 
 
241 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.72 
 
 
276 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
267 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.45 
 
 
441 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  39.57 
 
 
519 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
247 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.23 
 
 
395 aa  141  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
463 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.66 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.21 
 
 
425 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  40.25 
 
 
463 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
467 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
477 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  35.53 
 
 
478 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
394 aa  135  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  38.12 
 
 
248 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
426 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.17 
 
 
507 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  39.48 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 
419 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 
472 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.33 
 
 
478 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  36.32 
 
 
505 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  38.91 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  37.23 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.02 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.91 
 
 
482 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.18 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.54 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  36.16 
 
 
474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.64 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 
319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 
452 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
462 aa  128  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
540 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 
416 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.72 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 
516 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 
320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  35.87 
 
 
491 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.87 
 
 
491 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.87 
 
 
491 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 
517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.17 
 
 
264 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 
435 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 
469 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 
548 aa  124  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.04 
 
 
258 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 
239 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  36.32 
 
 
514 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.61 
 
 
258 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.04 
 
 
238 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  38.1 
 
 
216 aa  121  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  35.74 
 
 
325 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.16 
 
 
597 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  30.86 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  26.77 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  34.89 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.1 
 
 
247 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.03 
 
 
611 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  32.35 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  36.33 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.12 
 
 
280 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32 
 
 
287 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.02 
 
 
438 aa  118  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
321 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  31.46 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  34.73 
 
 
449 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.17 
 
 
466 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.8 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 
261 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>