57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5512 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  72.5 
 
 		 693 aa  1061    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1570    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  42.17 
 
 		 779 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  41.45 
 
 		 779 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  41.68 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  40.75 
 
 		 754 aa  555  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1022 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  36.4 
 
 		 990 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  38.15 
 
 		 814 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  32.57 
 
 		 815 aa  436  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  36.3 
 
 		 795 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  37.37 
 
 		 389 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  38.62 
 
 		 358 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  39.4 
 
 		 396 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  37.4 
 
 		 414 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.06 
 
 		 890 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.73 
 
 		 887 aa  61.6  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 		 907 aa  60.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 		 871 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.21 
 
 		 867 aa  57.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  32.43 
 
 		 956 aa  57.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.37 
 
 		 971 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.89 
 
 		 971 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 		 869 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  25.04 
 
 		 1240 aa  54.7  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  25.72 
 
 		 868 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.03 
 
 		 975 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  25.08 
 
 		 866 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  26.28 
 
 		 869 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.77 
 
 		 963 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  27.48 
 
 		 868 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  26.09 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  27.05 
 
 		 868 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  26.1 
 
 		 874 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.05 
 
 		 811 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  24.42 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.94 
 
 		 959 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.05 
 
 		 887 aa  49.3  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.67 
 
 		 950 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  25.91 
 
 		 868 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  26.17 
 
 		 891 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 868 aa  48.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 		 868 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 		 868 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.64 
 
 		 873 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  51.79 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  48.98 
 
 		 971 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0664  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.68 
 
 		 590 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 		 765 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0433  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  61.11 
 
 		 838 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1786  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  61.11 
 
 		 838 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.751715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.68 
 
 		 903 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 		 793 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  37.33 
 
 		 911 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0750  phosphotransferase system enzyme I  36.23 
 
 		 590 aa  44.3  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2648  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  65.62 
 
 		 958 aa  44.3  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.86 
 
 		 821 aa  44.3  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>