More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5455 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  100 
 
 
665 aa  1340  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  53.66 
 
 
662 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  51.3 
 
 
662 aa  583  1e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  36.5 
 
 
660 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  38.31 
 
 
667 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  38.69 
 
 
673 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  37.39 
 
 
695 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  34.51 
 
 
656 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  36.13 
 
 
629 aa  343  6e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  34.88 
 
 
629 aa  340  6e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  37.31 
 
 
665 aa  340  6e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  36.26 
 
 
695 aa  337  6e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  36.42 
 
 
642 aa  336  8e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  36.52 
 
 
671 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  34.88 
 
 
647 aa  329  1e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  34.59 
 
 
642 aa  328  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  36.5 
 
 
695 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  35.97 
 
 
643 aa  324  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  37.44 
 
 
630 aa  323  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  40.44 
 
 
629 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  33.08 
 
 
656 aa  322  1e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  39.62 
 
 
645 aa  319  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  35.01 
 
 
679 aa  317  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  35.99 
 
 
691 aa  315  2e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  33.23 
 
 
647 aa  308  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  38.12 
 
 
658 aa  306  8e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  31.97 
 
 
690 aa  303  6e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.52 
 
 
635 aa  303  8e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  33.64 
 
 
675 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  37.44 
 
 
679 aa  293  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  35.76 
 
 
690 aa  288  3e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  33.9 
 
 
635 aa  284  3e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.64 
 
 
632 aa  276  1e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  39.96 
 
 
637 aa  276  1e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  33.03 
 
 
683 aa  275  2e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.88 
 
 
660 aa  275  2e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  35.66 
 
 
759 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  31.49 
 
 
690 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  30.93 
 
 
654 aa  268  3e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.42 
 
 
640 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  33.23 
 
 
684 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  30.87 
 
 
651 aa  263  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  30.69 
 
 
660 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  33.53 
 
 
647 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.08 
 
 
645 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  28.48 
 
 
657 aa  258  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  28.92 
 
 
657 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  31.14 
 
 
652 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.92 
 
 
662 aa  255  2e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  32.04 
 
 
636 aa  254  4e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.06 
 
 
660 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  33.28 
 
 
628 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.77 
 
 
616 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  34.41 
 
 
638 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  32.28 
 
 
634 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.16 
 
 
660 aa  246  1e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.48 
 
 
639 aa  246  1e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  34.24 
 
 
621 aa  246  1e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  31.44 
 
 
614 aa  241  3e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.8 
 
 
658 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  30.78 
 
 
658 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.65 
 
 
658 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  27.61 
 
 
695 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.98 
 
 
615 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  32.1 
 
 
627 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  30.02 
 
 
626 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  28 
 
 
625 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  37.9 
 
 
583 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  31.71 
 
 
675 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.69 
 
 
711 aa  222  2e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  37.55 
 
 
678 aa  220  8e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  37.26 
 
 
644 aa  215  2e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.59 
 
 
716 aa  213  8e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.28 
 
 
675 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  35.05 
 
 
598 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  28.53 
 
 
777 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  39.22 
 
 
726 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  39.22 
 
 
726 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  39.22 
 
 
726 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.03 
 
 
690 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  28.11 
 
 
720 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.65 
 
 
681 aa  200  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  32.59 
 
 
603 aa  197  4e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28.29 
 
 
688 aa  196  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  32.24 
 
 
675 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.76 
 
 
632 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  31.14 
 
 
715 aa  194  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  28.26 
 
 
734 aa  194  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.96 
 
 
682 aa  193  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  28.05 
 
 
696 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  28.13 
 
 
742 aa  182  3e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  33.61 
 
 
718 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.99 
 
 
679 aa  177  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  28.61 
 
 
725 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  38.78 
 
 
720 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  30.31 
 
 
760 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  33.8 
 
 
604 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  33.8 
 
 
604 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0375  putative acyltransferase  31.94 
 
 
702 aa  168  3e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.020751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  32.77 
 
 
603 aa  166  1e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>