34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5432 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  331  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  73.51 
 
 		 160 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  72.85 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  72.19 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  71.52 
 
 		 160 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  70.86 
 
 		 160 aa  230  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  68.83 
 
 		 160 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  59.87 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  56.13 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  44 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  45.39 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  52.41 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  47.95 
 
 		 223 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  49.3 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  40.38 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  47.33 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  41.33 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  49.65 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  45.58 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  47.45 
 
 		 141 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  45.16 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  45.77 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  46.79 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  43.92 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  45.89 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  42.07 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  42.66 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  38.62 
 
 		 176 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  36 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  30.56 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>