More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5345 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 
475 aa  716  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  78.99 
 
 
476 aa  786  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  72.32 
 
 
474 aa  696  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  78.15 
 
 
476 aa  787  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  73.16 
 
 
476 aa  702  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  71.43 
 
 
480 aa  691  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  72.73 
 
 
476 aa  681  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  77.94 
 
 
476 aa  785  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  979  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  59.04 
 
 
481 aa  604  1e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
474 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
474 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
474 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
474 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  54.76 
 
 
474 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
474 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
474 aa  541  1e-152  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  54.19 
 
 
474 aa  538  1e-152  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  53.68 
 
 
474 aa  541  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  57.8 
 
 
485 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
474 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
476 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
479 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
475 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.23 
 
 
471 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
479 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 
473 aa  516  1e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
475 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 
473 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 
480 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 
480 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 
480 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 
480 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
475 aa  469  1e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  52.05 
 
 
480 aa  469  1e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 
472 aa  468  1e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 
480 aa  469  1e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 
478 aa  468  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
480 aa  466  1e-130  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
487 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
472 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  51.95 
 
 
472 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
510 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  447  1e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  48.48 
 
 
490 aa  445  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  49.56 
 
 
477 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 
467 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
490 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
475 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
484 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
470 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  49.44 
 
 
491 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 
511 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  47.66 
 
 
483 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  48.78 
 
 
491 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  48.78 
 
 
491 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
470 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
470 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  48.5 
 
 
473 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  49.78 
 
 
466 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
480 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  47.12 
 
 
474 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
476 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  48.5 
 
 
470 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
475 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
465 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
479 aa  417  1e-115  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  46.09 
 
 
479 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  45.49 
 
 
462 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
473 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
469 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  45.27 
 
 
469 aa  406  1e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  45.86 
 
 
481 aa  407  1e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  45.22 
 
 
479 aa  408  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
496 aa  407  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
460 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
498 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
483 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
473 aa  400  1e-110  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  44.97 
 
 
472 aa  399  1e-110  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
477 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
472 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
478 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  45.16 
 
 
477 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
477 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  46 
 
 
477 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 
472 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
481 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
465 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
477 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  41.03 
 
 
462 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 
459 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2120  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
474 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.536292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>