40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5294 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5294  malonate/sodium symporter MadM subunit  100 
 
 		 254 aa  487  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0823289  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5079  malonate transporter, MadM subunit  92.91 
 
 		 254 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0450  malonate/sodium symporter MadM subunit  92.52 
 
 		 254 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2446  malonate transporter, MadM subunit  87.8 
 
 		 254 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2051  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1268  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1240  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761133  normal  0.122304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0787  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4411  malonate/sodium symporter MadM subunit  78.35 
 
 		 255 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1158  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6324  malonate transporter, MadM subunit  79.13 
 
 		 255 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1146  malonate transporter, MadM subunit  78.74 
 
 		 255 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523152  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5375  malonate transporter, MadM subunit  77.95 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4945  malonate transporter, MadM subunit  77.47 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0533752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3869  malonate transporter, MadM subunit  77.47 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2804  malonate transporter, M subunit  74.8 
 
 		 255 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1612  malonate/sodium symporter MadM subunit  76.1 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3038  malonate transporter, M subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.218243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0537  malonate transporter, MadM subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1481  malonate transporter, MadM subunit  73.23 
 
 		 255 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0616  malonate transporter, MadM subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1450  malonate transporter, MadM subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.53305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1254  malonate transporter, MadM subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1580  malonate transporter, M subunit  73.62 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4284  malonate/sodium symporter MadM subunit  73.81 
 
 		 254 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0339134  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3149  malonate transporter, MadM subunit  70.75 
 
 		 254 aa  351  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6859  malonate transporter, MadM subunit  71.65 
 
 		 254 aa  347  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3195  malonate transporter, MadM subunit  68.9 
 
 		 254 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.585208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0044  malonate transporter, MadM subunit  69.29 
 
 		 254 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0292354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02640  putative malonate transporter, MadM subunit  66.54 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.519007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0300  malonate transporter subunit MadM  65.75 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.62285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1147  malonate/sodium symporter, MadM subunit  63.2 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.564343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0953  malonate/sodium symporter MadM subunit  62.3 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3290  malonate transporter, MadM subunit  61.02 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.864394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2875  signal transduction histidine kinase, LytS  66.01 
 
 		 254 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10360  malonate transporter, MadM subunit  65.08 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1551  malonate transporter, MadM subunit  60.89 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1065  malonate/sodium symporter MadM subunit  60.24 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1330  malonate/sodium symporter MadM subunit  58.33 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0218  putative malonate transporter, MadM subunit  62.86 
 
 		 36 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.826701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>