More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5282 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  52.96 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  57.68 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  56.18 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  55.43 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  54.69 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 483 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  31.43 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  31.82 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.17 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  33.33 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  30.85 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  30.94 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.18 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  34.34 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  26.23 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  26.53 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  29.94 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  33.53 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.05 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.08 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  31.37 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.05 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.37 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.27 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  33.59 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  29.96 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.03 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.8 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  26.64 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  24.11 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.52 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.81 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  26.82 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  24.55 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  28.19 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.55 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.6 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.13 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  28.02 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  27.56 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  26.84 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  28.49 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  23.85 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  23.66 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.58 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  26.47 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.27 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.35 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  26.05 
 
 		 599 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  22 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  25.45 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>