115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5254 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  82.39 
 
 
163 aa  283  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  79.63 
 
 
162 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  83.12 
 
 
174 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  79.63 
 
 
162 aa  280  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  76.54 
 
 
166 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  79.38 
 
 
174 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  77.16 
 
 
179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  75.93 
 
 
171 aa  266  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  77.16 
 
 
179 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  76.54 
 
 
179 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  69.94 
 
 
167 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  70.37 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  68.12 
 
 
165 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  61.88 
 
 
165 aa  220  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  61.73 
 
 
169 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  61.73 
 
 
169 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  61.73 
 
 
169 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  63.92 
 
 
165 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  63.29 
 
 
167 aa  213  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  63.92 
 
 
165 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  63.92 
 
 
165 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  63.92 
 
 
165 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  63.92 
 
 
165 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  63.29 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  57.67 
 
 
168 aa  209  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  59.26 
 
 
172 aa  205  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  58.23 
 
 
166 aa  204  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  59.04 
 
 
175 aa  203  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  62.35 
 
 
189 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  61.64 
 
 
175 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  56.79 
 
 
167 aa  202  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  56.79 
 
 
167 aa  201  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  58.64 
 
 
169 aa  200  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  61.39 
 
 
169 aa  200  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  60.65 
 
 
170 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  55.7 
 
 
175 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  56.33 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  56.79 
 
 
167 aa  195  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  54.66 
 
 
162 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  55.7 
 
 
169 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  54.04 
 
 
162 aa  193  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  56.29 
 
 
179 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  57.86 
 
 
177 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  55.97 
 
 
179 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  58.06 
 
 
164 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  56.33 
 
 
166 aa  189  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  55.21 
 
 
174 aa  187  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  55.21 
 
 
170 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  54.66 
 
 
169 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  54.66 
 
 
169 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  54.66 
 
 
169 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  54.66 
 
 
169 aa  185  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  52.17 
 
 
170 aa  185  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  57.5 
 
 
171 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  53.42 
 
 
173 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  55.77 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  57.59 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  53.12 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  54.43 
 
 
203 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  51.23 
 
 
168 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  50.93 
 
 
168 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  57.05 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  53.42 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  51.53 
 
 
168 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  55.63 
 
 
169 aa  177  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  47.83 
 
 
171 aa  177  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  53.5 
 
 
165 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  53.42 
 
 
174 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  53.42 
 
 
174 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  53.42 
 
 
174 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  47.2 
 
 
171 aa  175  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  51.33 
 
 
174 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  53.15 
 
 
153 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  47.83 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  50.94 
 
 
166 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  49.07 
 
 
199 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  57.42 
 
 
168 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  50.66 
 
 
167 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  49.02 
 
 
165 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  29.67 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  31.4 
 
 
245 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.25 
 
 
234 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  29.69 
 
 
308 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.91 
 
 
288 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  44.19 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.91 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  25.29 
 
 
285 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  27.91 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  23.86 
 
 
243 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  27.14 
 
 
242 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>