More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5126 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  93.3 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  92.34 
 
 		 209 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  89.47 
 
 		 210 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  88.04 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  90.43 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  82.3 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.07 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  43.54 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  42.11 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 239 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  44.29 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  39.15 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  37.62 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  39.52 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  38.1 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>