More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5106 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  80.53 
 
 
258 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.92 
 
 
258 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  73.18 
 
 
266 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  72.03 
 
 
266 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.29698e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.66 
 
 
262 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  71.65 
 
 
260 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.65 
 
 
260 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.65 
 
 
260 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.88 
 
 
260 aa  357  1e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.45506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  40.17 
 
 
259 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
263 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  39.32 
 
 
259 aa  179  5e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.79 
 
 
256 aa  178  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
257 aa  174  2e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
264 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79752e-08 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.38 
 
 
258 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
267 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
257 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
261 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6045e-07 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  166  3e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
261 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
266 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.49 
 
 
257 aa  164  1e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
269 aa  164  2e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
259 aa  163  2e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
275 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
259 aa  162  5e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.68 
 
 
265 aa  161  8e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
267 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
271 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
258 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
259 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
289 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.68 
 
 
265 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
262 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38.4 
 
 
275 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
267 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
267 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
264 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
267 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
257 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  38.21 
 
 
258 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
260 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
257 aa  155  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
263 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
273 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
298 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
271 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
264 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
259 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
256 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
291 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.35 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
255 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.4 
 
 
259 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
256 aa  147  1e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
268 aa  148  1e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
262 aa  147  1e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  147  2e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
259 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
258 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
265 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
281 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
281 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  37.5 
 
 
267 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
263 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
271 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
265 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
268 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
264 aa  141  1e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
266 aa  140  2e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
262 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
272 aa  139  4e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
258 aa  139  4e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.83 
 
 
268 aa  139  5e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
258 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
266 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.43 
 
 
264 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
260 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
255 aa  136  3e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
270 aa  136  3e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
266 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
262 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  37.61 
 
 
266 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
266 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
266 aa  135  6e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
263 aa  135  6e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
268 aa  135  6e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
268 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
268 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.3 
 
 
263 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
266 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
344 aa  135  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
262 aa  134  1e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  39.04 
 
 
265 aa  134  1e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
262 aa  134  1e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>