116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5039 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  75.81 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  75 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  66.27 
 
 		 248 aa  342  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  67.07 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  63.01 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  62.6 
 
 		 256 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  60.57 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  60.98 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  59.84 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  59.84 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  57.44 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  60.67 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  55.34 
 
 		 259 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  52.57 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  56.68 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  55.28 
 
 		 267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  54.66 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.3 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  29.08 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  23.83 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  30.1 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.5 
 
 		 596 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  26.36 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  24.76 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.97 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  30 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  25 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.45 
 
 		 868 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.01 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  25.97 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.84 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  23.73 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  25.96 
 
 		 451 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  35.78 
 
 		 968 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.69 
 
 		 653 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 		 735 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  36.63 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1815  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.97 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  25.64 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.45 
 
 		 622 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  29.69 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 		 651 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  32.26 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  32.65 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.65 
 
 		 653 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.67 
 
 		 723 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  25.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  22.14 
 
 		 648 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  26.39 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  32.46 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  31.69 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.7 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  31.11 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.41 
 
 		 365 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 		 652 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  28 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  28.36 
 
 		 876 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  27.53 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 		 653 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.75 
 
 		 688 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.96 
 
 		 680 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.25 
 
 		 677 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  21.05 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  27.34 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  30.84 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.83 
 
 		 588 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  25.69 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.38 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.17 
 
 		 709 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.39 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  26.67 
 
 		 356 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  30.93 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.79 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  25.71 
 
 		 683 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.75 
 
 		 649 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  27.32 
 
 		 674 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.8 
 
 		 593 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  29.29 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  32.98 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>