233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5029 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  64.1 
 
 
227 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  54.51 
 
 
228 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  54.31 
 
 
226 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  53.42 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  55.71 
 
 
228 aa  237  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  48.52 
 
 
232 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  48.52 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  56.9 
 
 
227 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  57.76 
 
 
227 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  56.47 
 
 
227 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  56.47 
 
 
227 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  45.92 
 
 
224 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  46.29 
 
 
227 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  44.09 
 
 
223 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  42.13 
 
 
215 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  44.12 
 
 
218 aa  175  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  41.81 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  43.35 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  42.41 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  41.53 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  41.53 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  41.38 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  43.83 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  40.09 
 
 
214 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  42.34 
 
 
210 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  41.1 
 
 
214 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  41.07 
 
 
210 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  42.44 
 
 
214 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  42.44 
 
 
214 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  44.07 
 
 
215 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  40.43 
 
 
212 aa  168  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  40 
 
 
212 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  40 
 
 
212 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  40.43 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  40.43 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  40.43 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  40.43 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  40.43 
 
 
212 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  42.17 
 
 
211 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  42.33 
 
 
237 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  41.37 
 
 
237 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  41.6 
 
 
214 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  42.02 
 
 
215 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  40.17 
 
 
211 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  42.61 
 
 
214 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  39.74 
 
 
211 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  39.74 
 
 
211 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  40.53 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  42.8 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  44.02 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  40.43 
 
 
215 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  40.34 
 
 
209 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  39.57 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  38.82 
 
 
218 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  37.83 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  36.67 
 
 
217 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  37.93 
 
 
202 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.58 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  34.58 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  34.47 
 
 
209 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  39.04 
 
 
202 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  36.19 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  35.62 
 
 
210 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  37.68 
 
 
211 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  33.82 
 
 
203 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  33.82 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  33.48 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  30.92 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  30.48 
 
 
209 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  30.74 
 
 
241 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  30.74 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.25 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  32.47 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  30.41 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  32.64 
 
 
195 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  32.64 
 
 
195 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  29.31 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  28.81 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  31.8 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  31.58 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.11 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  30.13 
 
 
224 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  27.65 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  27.59 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  32 
 
 
216 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  32.62 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  28.94 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  33.33 
 
 
198 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  35.27 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  30.7 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  31.09 
 
 
208 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  34.08 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  30.41 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>