61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4997 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  47.74 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  47.56 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  36 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  36 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  37.34 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  36.51 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  36.93 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.96 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  34.92 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  37.93 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  30.71 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  40.69 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  30.29 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30.29 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  30.96 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.82 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  39.31 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.51 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  40.14 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.24 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  26.51 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  32 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  35.14 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  29.72 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  24.21 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  24.5 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  29.93 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  27.51 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.2 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  23.28 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.35 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.36 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.96 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  24.77 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  33.33 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  33.04 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  37.35 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.97 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.35 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  23.25 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  25.11 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  31.52 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  23.35 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.46 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.11 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  23.13 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.47 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  28.06 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.47 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  23.32 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.92 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  27.93 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  26.42 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  21.94 
 
 		 211 aa  42  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>