More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4851 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  338  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  82.84 
 
 		 169 aa  285  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  81.66 
 
 		 169 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  85.88 
 
 		 168 aa  279  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  79.19 
 
 		 173 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  79.88 
 
 		 167 aa  268  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  85.38 
 
 		 176 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  85.38 
 
 		 171 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  84.8 
 
 		 171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  84.8 
 
 		 171 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  70.48 
 
 		 169 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  56.86 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  51.01 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  50.99 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  54.05 
 
 		 181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  48.08 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  47.17 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  44.65 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  43.11 
 
 		 235 aa  137  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  52.63 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  52.63 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  49.02 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  46.47 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  45.12 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.19 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  43.83 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  51.63 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  45.29 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  48.2 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  45.62 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  44.19 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  44.79 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  46.63 
 
 		 216 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  49.64 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>