73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4829 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  100 
 
 
175 aa  353  9e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  78.66 
 
 
177 aa  266  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  78.26 
 
 
174 aa  261  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  72.56 
 
 
182 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  52.1 
 
 
181 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  53.02 
 
 
146 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  55.32 
 
 
144 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  53.02 
 
 
149 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  49.38 
 
 
167 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  50.66 
 
 
151 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  45.91 
 
 
165 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  47.88 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  43.09 
 
 
206 aa  139  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  41.67 
 
 
184 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  49.69 
 
 
165 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  47.53 
 
 
155 aa  129  2e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  43.37 
 
 
159 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  43.68 
 
 
178 aa  126  1e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  40.79 
 
 
151 aa  82.4  3e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  36.25 
 
 
162 aa  80.9  9e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  31.17 
 
 
174 aa  79  3e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  33.77 
 
 
200 aa  75.9  2e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  32.03 
 
 
153 aa  73.9  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  30.43 
 
 
163 aa  70.5  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  34.17 
 
 
143 aa  63.2  2e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  32.3 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  30.5 
 
 
158 aa  60.1  2e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  31.06 
 
 
160 aa  59.3  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  29.49 
 
 
189 aa  60.1  2e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  32.24 
 
 
190 aa  59.3  3e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  33.09 
 
 
158 aa  58.9  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  57.8  8e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  36.04 
 
 
190 aa  57.4  9e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  31.69 
 
 
189 aa  57  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  8.5919e-08  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  40.51 
 
 
178 aa  57  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  33.11 
 
 
179 aa  56.2  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.97 
 
 
142 aa  56.2  2e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  31.62 
 
 
164 aa  55.1  5e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32.39 
 
 
148 aa  53.1  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  30.83 
 
 
153 aa  53.1  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32.39 
 
 
148 aa  53.1  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  38.16 
 
 
176 aa  52.8  3e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32.39 
 
 
148 aa  51.6  5e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  26.03 
 
 
145 aa  50.8  9e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  27.4 
 
 
145 aa  50.4  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  26.03 
 
 
145 aa  50.4  1e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  28.28 
 
 
146 aa  50.8  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  50.1  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  27.33 
 
 
155 aa  49.7  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  34.42 
 
 
146 aa  49.3  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  25.34 
 
 
145 aa  48.9  4e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  33.11 
 
 
180 aa  48.9  4e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  31.36 
 
 
201 aa  48.5  5e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  26.9 
 
 
148 aa  48.1  7e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  31.08 
 
 
197 aa  47.8  8e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  25.52 
 
 
148 aa  47.8  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  27.59 
 
 
145 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  26.21 
 
 
148 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  32.63 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  32.98 
 
 
218 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  29.19 
 
 
188 aa  44.3  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  29.63 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  30.19 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  35 
 
 
208 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
143 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  33.14 
 
 
217 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  36 
 
 
234 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  28.29 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  26.52 
 
 
152 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  30.26 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  33.66 
 
 
245 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>