More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4819 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  51.09 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  50.36 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  50.36 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  49.64 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  52.86 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  48.06 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  41.01 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  38.71 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  43.94 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  48.39 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  44.44 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.59 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  36.62 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  37.5 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  57.14 
 
 		 196 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  56.45 
 
 		 179 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  43.17 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  46.53 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  41.98 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  67.35 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  41.38 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  49.25 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  35.85 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  32.86 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.59 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  36.64 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  34.38 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  47.92 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  62 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  40 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  31.29 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  58.49 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  48.53 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  62.75 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.37 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  39.31 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  65.31 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  38.06 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  56.6 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.47 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  36.42 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  36.42 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  36.42 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  34.44 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.53 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  33.76 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  58 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  56.14 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  38.32 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  54.84 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  48.39 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  54.24 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  50.82 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  43.82 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  37.38 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  34.15 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.1 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  38.67 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  58.18 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.53 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  43.97 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35.88 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  38 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  47.46 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  58.18 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.75 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  56.36 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.61 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  55.1 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.38 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  50 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  37.8 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  55.1 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  32.11 
 
 		 180 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  52 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  76.47 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  42.68 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  43.14 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.16 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  55.32 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.96 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  53.06 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  67.5 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.42 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  69.44 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  61.22 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.62 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  71.43 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.45 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  73.53 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  41.49 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  55.1 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  56 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  40.74 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  50 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>