More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4813 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  55.74 
 
 		 545 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  87.91 
 
 		 554 aa  1030    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  88.99 
 
 		 554 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  75.09 
 
 		 554 aa  889    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  77.44 
 
 		 554 aa  918    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 		 545 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  89.53 
 
 		 554 aa  1045    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  76.17 
 
 		 554 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  90.07 
 
 		 554 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  88.81 
 
 		 554 aa  1040    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  56.11 
 
 		 545 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 554 aa  1152    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  56.3 
 
 		 545 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  88.99 
 
 		 554 aa  1040    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  80.51 
 
 		 554 aa  957    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  56.11 
 
 		 545 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  58.52 
 
 		 548 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  89.35 
 
 		 554 aa  1042    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  82.13 
 
 		 554 aa  970    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  56.3 
 
 		 545 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  56.11 
 
 		 545 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  55.19 
 
 		 545 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  81.05 
 
 		 554 aa  960    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  56.48 
 
 		 545 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  56.11 
 
 		 545 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  54.53 
 
 		 545 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  55 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  55.74 
 
 		 545 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  55.06 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  54.7 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  54.95 
 
 		 547 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  53.58 
 
 		 549 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 		 547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 567 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 		 549 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  52.93 
 
 		 552 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  52.95 
 
 		 548 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 		 548 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  52.15 
 
 		 562 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 		 550 aa  588  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 550 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  51.66 
 
 		 548 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  51.96 
 
 		 548 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 552 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 549 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  52.9 
 
 		 559 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  51.57 
 
 		 550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 550 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 		 550 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  50.74 
 
 		 560 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 547 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  50.67 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  49.35 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 549 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  51.57 
 
 		 547 aa  551  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  48.89 
 
 		 543 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 649 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  48.52 
 
 		 549 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 		 545 aa  539  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  47.03 
 
 		 547 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 554 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  46.04 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  46.55 
 
 		 553 aa  531  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 539 aa  531  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>