More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4807 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 981 aa  781    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  82.94 
 
 		 983 aa  1663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  91.73 
 
 		 991 aa  1812    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  92.97 
 
 		 982 aa  1843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  91.63 
 
 		 991 aa  1809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  92.57 
 
 		 984 aa  1808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  100 
 
 		 982 aa  1992    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  49.12 
 
 		 986 aa  840    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  79 
 
 		 981 aa  1575    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  92.14 
 
 		 991 aa  1817    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  91.63 
 
 		 991 aa  1808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  47.93 
 
 		 1000 aa  891    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  87.63 
 
 		 984 aa  1746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 985 aa  813    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  48.32 
 
 		 975 aa  857    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 		 987 aa  959    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  82.32 
 
 		 983 aa  1659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1323 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  25.72 
 
 		 1323 aa  301  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.99 
 
 		 1161 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  27.28 
 
 		 950 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 1145 aa  288  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  32.83 
 
 		 1039 aa  283  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.91 
 
 		 1083 aa  283  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  26.75 
 
 		 1159 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  26.65 
 
 		 1159 aa  281  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  28.17 
 
 		 1148 aa  280  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 		 1171 aa  279  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 1159 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 1156 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 1159 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 1158 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 1159 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  26.01 
 
 		 1157 aa  274  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 1071 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  26.94 
 
 		 1174 aa  271  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 917 aa  271  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 894 aa  270  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.5 
 
 		 1158 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  31.63 
 
 		 894 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.93 
 
 		 1168 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 893 aa  268  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 920 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.55 
 
 		 1082 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 		 1167 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 897 aa  264  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1152 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 1147 aa  263  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 1174 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 932 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 1168 aa  260  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  36.83 
 
 		 927 aa  260  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.21 
 
 		 1088 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 1163 aa  259  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.16 
 
 		 1169 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1168 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1168 aa  257  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 1172 aa  257  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1172 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  34.34 
 
 		 906 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  25.22 
 
 		 1006 aa  255  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.62 
 
 		 1179 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  24.93 
 
 		 1147 aa  254  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 1175 aa  254  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  32.08 
 
 		 919 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  35.47 
 
 		 913 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 903 aa  252  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.09 
 
 		 1087 aa  251  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  33.26 
 
 		 1079 aa  250  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 919 aa  250  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  32.22 
 
 		 935 aa  250  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  30.73 
 
 		 671 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1138 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  35.01 
 
 		 1087 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  25.53 
 
 		 1177 aa  248  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  32.84 
 
 		 910 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 894 aa  245  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 1316 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 1152 aa  243  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 885 aa  239  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 1070 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 896 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 		 1185 aa  233  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  25.92 
 
 		 1169 aa  231  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 1169 aa  230  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.78 
 
 		 1150 aa  227  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.77 
 
 		 1156 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  25.41 
 
 		 1145 aa  225  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1170 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 		 1161 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 945 aa  221  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  32.42 
 
 		 1100 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.98 
 
 		 1140 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.3 
 
 		 1169 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 1055 aa  217  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1169 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1069 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1069 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 1070 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  24.56 
 
 		 1146 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>