24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4761 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  86.96 
 
 		 415 aa  723    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  100 
 
 		 416 aa  855    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  39.1 
 
 		 859 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  35.52 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  33.43 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  50.33 
 
 		 656 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  36.02 
 
 		 789 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  49.32 
 
 		 731 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  32.69 
 
 		 655 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  33.85 
 
 		 643 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  38.03 
 
 		 758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  32.69 
 
 		 862 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  33.21 
 
 		 546 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  37.75 
 
 		 561 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  51.32 
 
 		 83 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1233  hypothetical protein  28.63 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0876385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2282  hypothetical protein  28.63 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  37.5 
 
 		 106 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  27.39 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  27.39 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  27.39 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  29.32 
 
 		 592 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0118  putative colicin  40 
 
 		 79 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>