More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4699 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.33 
 
 
449 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.83 
 
 
448 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.88 
 
 
449 aa  732    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.34 
 
 
449 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.79 
 
 
449 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
451 aa  926    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  83 
 
 
449 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.84 
 
 
453 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
448 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.7 
 
 
448 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.21 
 
 
449 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 
435 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 
436 aa  510  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 
439 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
430 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 
449 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
434 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
455 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
434 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
429 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
435 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.69 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
435 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
434 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
430 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
337 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
335 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
338 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
334 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
361 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
362 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
365 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
341 aa  352  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
331 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
332 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
332 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
332 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
332 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 
336 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
341 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
353 aa  315  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
335 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
322 aa  279  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
319 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
322 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
319 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
319 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
323 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
322 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
325 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  43.03 
 
 
322 aa  259  9e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
321 aa  252  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
325 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
319 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
321 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
325 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
321 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
321 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
324 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
331 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
324 aa  227  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
325 aa  226  8e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
319 aa  216  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
336 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
328 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
330 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
330 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
330 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
339 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
330 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
327 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
327 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
347 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
326 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
360 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
331 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
334 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
339 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
333 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
344 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
328 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
328 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
334 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>