More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4654 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  84.18 
 
 		 314 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  84.85 
 
 		 298 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  79.67 
 
 		 299 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  80 
 
 		 299 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  80 
 
 		 299 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  81.02 
 
 		 299 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  60.34 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  42.31 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  41.75 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  41.05 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  40.99 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  40.99 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  40.99 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  40.99 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  41.75 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  41.75 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  42.11 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  41.24 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  40.28 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  41.4 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  41.4 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  40.99 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  41.4 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  39.58 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  37.76 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  37.5 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  38.11 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  39.5 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  37.41 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  38.11 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  36.36 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  36.08 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.65 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  36.18 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.49 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  39.1 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  37.02 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  38.36 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  36.3 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  36.86 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  38.75 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  34.93 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  35.64 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  36.86 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  36.86 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  38.68 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  36.45 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  36.3 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.61 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  38.03 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  37.98 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  37.98 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  37.46 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  36.97 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  36.18 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.18 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  36.24 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  37.63 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  37.98 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  35.47 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  36.64 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  34.01 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  37.34 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  36.63 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  35.34 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  33.89 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  38.72 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  35.34 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  34.23 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  33.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  32.89 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  33.9 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  35.57 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  37.58 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  36.17 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  37.58 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  33.56 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  36.59 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  34.23 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  36.18 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  36.59 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  36.59 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  36.59 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0285  putative chemotaxis protein CheV  34.59 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  35.79 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  34.86 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  35.59 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  36.27 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  34.51 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  33.09 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  34.14 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  35.64 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.77 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  36.86 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>