29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4429 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  78.67 
 
 		 153 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  77.7 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  70.95 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  62 
 
 		 209 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  62 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  62 
 
 		 209 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4977  hypothetical protein  60.14 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.204636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57250  hypothetical protein  60.8 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  38.58 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  37.69 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  33.82 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  28.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  27.34 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  34.19 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  30.4 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  31.62 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  26.45 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  28.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2193  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00409116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  30.34 
 
 		 148 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>