234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4419 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  100 
 
 		 448 aa  914    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  69.45 
 
 		 447 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  67.11 
 
 		 448 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  67.11 
 
 		 441 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  64.6 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  46.77 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  47.93 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  47.71 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  44.81 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  42.51 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  40.78 
 
 		 445 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  40.83 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  44.83 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  44.66 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  40.77 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  43.02 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  41.87 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  41.65 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  43.15 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  43.15 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  40.65 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  41.77 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  41.05 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  41.86 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  42.27 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  39.91 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  39.91 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  39.91 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  39.91 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  40.87 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  40.76 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  42.82 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  39.61 
 
 		 479 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  38.51 
 
 		 435 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  40.27 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  41.41 
 
 		 417 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  38.07 
 
 		 435 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  42.76 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  39.42 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  38.05 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  38.28 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  40.35 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  40.13 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  42.11 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  40.26 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  39.83 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  39.83 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  39.57 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  38.83 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  40 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  39.34 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  40 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  39.78 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  39.81 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  36.45 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  38.22 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  38.61 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  36.98 
 
 		 454 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  36.44 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  37.95 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  38.5 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  37.53 
 
 		 484 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  37.79 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  37.06 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  36.55 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  36.94 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  38.24 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  37.8 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  35.89 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  36.73 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  37.06 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  35.37 
 
 		 471 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  37.55 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  36.58 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  36.4 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  37.28 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  34.49 
 
 		 471 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1248  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 486 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1539  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 486 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1729  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 486 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  34.57 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  37 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3014  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 527 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0532717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2898  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 527 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0390  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 527 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0356  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  36.83 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2214  OprD family outer membrane porin  35.51 
 
 		 501 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  35.5 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  35.73 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.27 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  35.62 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  34.99 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  36.77 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  35.27 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  35.57 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  34.41 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.64 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  36.6 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.89 
 
 		 413 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>