More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4359 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  100 
 
 		 393 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  47.16 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  41.75 
 
 		 437 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  40.21 
 
 		 441 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  41.53 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  41.26 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  29.64 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  28.68 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  25 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  32.89 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  34.53 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  31.11 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  32.09 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  29.1 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  27.2 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.11 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  31.11 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  30.04 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.17 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  26.12 
 
 		 488 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  28.82 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  25.64 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  23.55 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  25.28 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  25.59 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  26.55 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.02 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  28.57 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  25.19 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.07 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  24.35 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  27.56 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  21.11 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.58 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.15 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  26.1 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  28.82 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  28.87 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  28.87 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  28.87 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  25.15 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  23.86 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  28.87 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.5 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  25.27 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.53 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  31.08 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.51 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.64 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  26.76 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.37 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.24 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  26.33 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  23.58 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  28.95 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  24.17 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.35 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  23.68 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.05 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  26.94 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.89 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  27.27 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  24.65 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.51 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.55 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.8 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.48 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.93 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.46 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  22.81 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.55 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  25.1 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.55 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.33 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  26.33 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.33 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  22.16 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.55 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  22.56 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  23.84 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.16 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  27.12 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.69 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  23.84 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  26.57 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  30.53 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.55 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  22.56 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.16 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.84 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.84 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  23.87 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.02 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.1 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  30.34 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  24.21 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>