88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4128 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  81.1 
 
 		 165 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  50.6 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  52.98 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  65.09 
 
 		 481 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  68 
 
 		 469 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  44.24 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  63.11 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  62.5 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  58.49 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  41.94 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  43.9 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  45.83 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  31.25 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  49.15 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  49.15 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  49.15 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  36.08 
 
 		 885 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  30.46 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  28.83 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  45.16 
 
 		 96 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  47.46 
 
 		 88 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  46.59 
 
 		 89 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 89 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 100 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  43.21 
 
 		 102 aa  48.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  43.16 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  41.67 
 
 		 99 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  34.74 
 
 		 908 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  46 
 
 		 88 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  49.02 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  41.49 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 99 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  44.23 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  36.76 
 
 		 895 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  27.61 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  41.75 
 
 		 456 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  39.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  30.49 
 
 		 540 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  33.11 
 
 		 466 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  28.12 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  45.59 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  31.82 
 
 		 911 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  36.14 
 
 		 898 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  41.54 
 
 		 1410 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1229 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  36.84 
 
 		 87 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 456 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  41.51 
 
 		 1111 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.28 
 
 		 855 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  31.4 
 
 		 725 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  36.62 
 
 		 1422 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  40.62 
 
 		 1475 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  37.7 
 
 		 1423 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  40.62 
 
 		 1457 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 100 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  41.51 
 
 		 1111 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  33.72 
 
 		 85 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  41.51 
 
 		 1111 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  33.78 
 
 		 1495 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  39.06 
 
 		 1386 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 85 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  41.51 
 
 		 1111 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  48.72 
 
 		 912 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  40.48 
 
 		 592 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1381 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1541 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  44.44 
 
 		 1437 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 		 979 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>