137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4105 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  221  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1628  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3752  hypothetical protein  82.73 
 
 		 110 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21660  hypothetical protein  77.78 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1846  hypothetical protein  75.93 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1247  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.288271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  64 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  62.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  59 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  50.49 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  63.92 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  58.76 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  63.92 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  55.24 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  52.38 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  50.94 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  56.6 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  63.92 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  57.89 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  65.98 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  49 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  49 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1459  hypothetical protein  62.89 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  48 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0423  hypothetical protein  62 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183716  normal  0.508856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0659  hypothetical protein  61 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  61.32 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4121  protein of unknown function UPF0060  59.43 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  61.86 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  46.08 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  49.06 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  47 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  44.64 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  45.1 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  53.12 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  49 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5886  hypothetical protein  61.29 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3409  hypothetical protein  57 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  44.86 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  43.4 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  49 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2889  protein of unknown function UPF0060  49.48 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  hitchhiker  0.00858506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0929  hypothetical protein  53.76 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  42.73 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  46.08 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1789  hypothetical protein  53.76 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0436  hypothetical protein  53.76 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  44 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  46 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  40.18 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  42.16 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1380  hypothetical protein  57 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.114709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  46.08 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  44.09 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  39 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  45 
 
 		 222 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  39 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  34.86 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  43.88 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  42.31 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  35.78 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  39 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  36.7 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  34.86 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  46.24 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  39 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  39 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1658  hypothetical protein  55.91 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.417469 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  38.24 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>