More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4091 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
99 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  84.38 
 
 
97 aa  172  2e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  85.11 
 
 
95 aa  171  4e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  74.75 
 
 
99 aa  162  2e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  77.08 
 
 
98 aa  160  5e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  76.04 
 
 
98 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  76.04 
 
 
98 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  75 
 
 
97 aa  156  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  75.79 
 
 
102 aa  153  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  70.71 
 
 
101 aa  151  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  71.72 
 
 
101 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  53.4 
 
 
103 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  50 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  51.92 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  51.46 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  51.96 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  49.5 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  47 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  46.15 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  45.45 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  47.57 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  44.12 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  46.46 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 
106 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 
106 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 
106 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.09706e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  45.45 
 
 
104 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  45.92 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  48.54 
 
 
105 aa  82.8  1e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  44.12 
 
 
104 aa  83.2  1e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  44.44 
 
 
99 aa  82.4  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  42.42 
 
 
99 aa  81.6  3e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  46.46 
 
 
102 aa  81.3  4e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  45.88 
 
 
99 aa  80.5  8e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  80.5  8e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  47.06 
 
 
106 aa  79.3  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  40.37 
 
 
110 aa  78.6  2e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.29362e-12  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  43.43 
 
 
104 aa  78.6  3e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.77187e-06  hitchhiker  2.75713e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  44.9 
 
 
106 aa  78.6  3e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  43.16 
 
 
99 aa  77.4  5e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.55602e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.63176e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.27919e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.54579e-07  hitchhiker  7.47363e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.13477e-08  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  45.54 
 
 
105 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66564e-08  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  43.88 
 
 
106 aa  77.4  6e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  42.27 
 
 
97 aa  77  7e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  41.41 
 
 
99 aa  75.9  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  45.45 
 
 
104 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.07281e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  45.65 
 
 
114 aa  75.1  3e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  43.88 
 
 
106 aa  75.1  3e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  43 
 
 
103 aa  74.7  4e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  45.65 
 
 
114 aa  74.7  4e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.29176e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.05516e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  9.73663e-05  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  43.56 
 
 
105 aa  73.2  1e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  40.4 
 
 
99 aa  70.5  7e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  42.35 
 
 
106 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  42.35 
 
 
97 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  42.35 
 
 
106 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  42.35 
 
 
106 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  42.35 
 
 
106 aa  67.8  4e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.18 
 
 
92 aa  67.8  5e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  48.68 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  44 
 
 
80 aa  64.7  4e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  58.82 
 
 
85 aa  64.7  4e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  41.12 
 
 
105 aa  63.9  6e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  38.24 
 
 
102 aa  63.9  7e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  42.05 
 
 
82 aa  63.9  7e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  46.05 
 
 
80 aa  63.9  8e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  41.12 
 
 
105 aa  63.5  9e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  45.9 
 
 
82 aa  60.8  6e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  37.37 
 
 
99 aa  60.8  6e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  45.9 
 
 
82 aa  60.8  6e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  49.15 
 
 
82 aa  60.5  7e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  47.46 
 
 
80 aa  60.5  8e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  55.56 
 
 
85 aa  60.1  9e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  2.72447e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  55.56 
 
 
85 aa  60.1  9e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  52.63 
 
 
80 aa  60.1  1e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  46.27 
 
 
81 aa  60.1  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  46.38 
 
 
92 aa  60.1  1e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  48.33 
 
 
81 aa  59.7  1e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  52.63 
 
 
78 aa  60.1  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  46.03 
 
 
82 aa  58.9  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  43.84 
 
 
83 aa  59.3  2e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  52.83 
 
 
85 aa  58.9  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  48.28 
 
 
85 aa  58.9  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  39.77 
 
 
91 aa  59.3  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
86 aa  59.3  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  50.88 
 
 
78 aa  58.9  2e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  38.46 
 
 
84 aa  58.5  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  43.55 
 
 
83 aa  58.5  3e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  44.19 
 
 
96 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  41.56 
 
 
81 aa  58.2  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>