105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4089 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  75.24 
 
 		 212 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  76.08 
 
 		 210 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  75 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  70.48 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  73.68 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  71.43 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  73.81 
 
 		 210 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  70.33 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  70.85 
 
 		 199 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  66.67 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  49.74 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  41.06 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  46 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  42.36 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  44.22 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  43.72 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  40.39 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  35.24 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  35.82 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  35.6 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  38.28 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  37.5 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  37.56 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  34.38 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  30.61 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  34.88 
 
 		 245 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  28.71 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  29.63 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  33.51 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  34.02 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  26.46 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.67 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  34.34 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.52 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  30.95 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  31.32 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  34 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  27.37 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  34.02 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  31.38 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  31.47 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  34.72 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.84 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.32 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  25.15 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.32 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  31.77 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.26 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  26.73 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  24.21 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.47 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  28.73 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  28.34 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  28.34 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  28.65 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  28.73 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.8 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  27.91 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.68 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.22 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  27.88 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.82 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.82 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.04 
 
 		 336 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.22 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  26.26 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  27.41 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  24 
 
 		 297 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2656  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  27.64 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  24.63 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  24.76 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>