More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3939 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  65.17 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  64.79 
 
 		 274 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  61.28 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  61.28 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  61.28 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  61.28 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  60.15 
 
 		 271 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  60.9 
 
 		 328 aa  324  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  59.02 
 
 		 274 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  57.52 
 
 		 274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  57.52 
 
 		 274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  56.02 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  56.02 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  52.79 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  47.01 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  45.52 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  42.38 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  32.72 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.5 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.8 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.45 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.45 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.94 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  32.32 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 		 393 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.75 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.18 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 		 393 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 392 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.11 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>