More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3895 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 341 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  84.12 
 
 		 340 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  69.37 
 
 		 340 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  68.47 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  68.77 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  68.77 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  68.17 
 
 		 340 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  62.61 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  68.17 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  70.57 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  70.87 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  70.87 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  70.87 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  68.47 
 
 		 340 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  70.57 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  70.87 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  70.87 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  67.06 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  67.06 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  67.06 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  67.16 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  66.77 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  66.77 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  66.77 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  66.77 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  58.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  65.47 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  49.09 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  48.96 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  46.42 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  46.29 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  46.38 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  45.02 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  43.2 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  42.18 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  43.94 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  42.39 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  41 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  41 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  40.71 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  41.3 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  41.76 
 
 		 346 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  41.18 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  38.17 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.13 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  41.3 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  38.46 
 
 		 344 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  40.59 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  43.03 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  39.94 
 
 		 343 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  42.73 
 
 		 358 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  41.97 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  42.18 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  38.14 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  40.54 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  41 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  39.58 
 
 		 356 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  39.42 
 
 		 577 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  38.14 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 578 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  41.25 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  32.66 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  38.99 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  35.95 
 
 		 582 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  43.18 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.91 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  40 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  41.44 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.88 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.02 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  39.11 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  31.95 
 
 		 407 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.84 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  32.74 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.44 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  38.61 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.5 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.69 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  39.68 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.37 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  41.15 
 
 		 378 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.67 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  39.15 
 
 		 354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>