More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3864 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  82.67 
 
 		 429 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 432 aa  733    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  85.95 
 
 		 430 aa  743    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  75.73 
 
 		 435 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  100 
 
 		 430 aa  860    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  83.37 
 
 		 429 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  74 
 
 		 429 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  73.7 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  73.81 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  74.22 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  72.14 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  70.95 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  71.05 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  70.95 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  70.59 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  72.37 
 
 		 477 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  71.5 
 
 		 433 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  70.41 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  70.41 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  71.64 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  70.41 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  70.41 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  70.41 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  69.93 
 
 		 446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  70.17 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  69.93 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  71.15 
 
 		 439 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  69.59 
 
 		 454 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  69.29 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  69.29 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  69.29 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.3 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.71 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.3 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  67.3 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.12 
 
 		 431 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.47 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  68.52 
 
 		 477 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.6 
 
 		 431 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.58 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  64.94 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  66.43 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  64.39 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.42 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  67.23 
 
 		 437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.88 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  65.71 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.01 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.26 
 
 		 440 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  66.5 
 
 		 439 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  64.73 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  65.93 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.5 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  61.5 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  61.5 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  61.5 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  61.5 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  61.5 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  62.5 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  62.22 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  60.1 
 
 		 431 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  62.01 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  59.61 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  58.99 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  62.37 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  57.42 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  44.61 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  46.33 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.28 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  43.73 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 443 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 438 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 443 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.76 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.34 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.77 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  40.1 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  40.1 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>