More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3843 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
358 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  33.99 
 
 
378 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  32.12 
 
 
371 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
304 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
376 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.46 
 
 
369 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
393 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.22 
 
 
419 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
399 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
385 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
388 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
388 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
389 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
389 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
396 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
389 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
415 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  25.82 
 
 
381 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
389 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
398 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
387 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  30.26 
 
 
401 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  26.9 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
383 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
414 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
403 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
399 aa  95.9  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.22 
 
 
388 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
360 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.45 
 
 
361 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
365 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
375 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
419 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  27.3 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
704 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
374 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
404 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
394 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.47 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
748 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  26.28 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.85 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
689 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
362 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
397 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
360 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
355 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
396 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
435 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
419 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  26.78 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.51 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>