More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3801 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  76.65 
 
 		 262 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  75.58 
 
 		 261 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  69.88 
 
 		 263 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  64.17 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  64.98 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  65.49 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  63.74 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  67.45 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  64.06 
 
 		 262 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  51.49 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  49.07 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  49.48 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  48.86 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  49.47 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  40.66 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  47.2 
 
 		 227 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  39.6 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  41.2 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  37.1 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  38.05 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  37.61 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  39.9 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  35 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  35.94 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  36.28 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  36.36 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  35.51 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  38.86 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  35.98 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  35.47 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  35.34 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  35.15 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  34.86 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  35 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  37.56 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.48 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  34.06 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.16 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  35.87 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  35.12 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.4 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  35.86 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  36.41 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  34.75 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  35.07 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  33.79 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.76 
 
 		 331 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  33.95 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.76 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  36.76 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  34.58 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  33.89 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  32.74 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  34.1 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  32.9 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  34.12 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  34.29 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.04 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  35.12 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  34.33 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  29.67 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  35.87 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  31.42 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.42 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  36.19 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  34.23 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  34.76 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.78 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  34.85 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  34.87 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  34.86 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  35.05 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  33.78 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  34.26 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  35 
 
 		 298 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  33.8 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  32.03 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  34.47 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  36.17 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  32.88 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  34.78 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  34.52 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  33.18 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  32.74 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  34.98 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  33.8 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>