106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3766 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  308  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  60.14 
 
 		 144 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  58.33 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  59.44 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  59.44 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  59.72 
 
 		 144 aa  158  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  58.33 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  57.64 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  62.18 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  39.71 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  38.13 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  37.41 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  37.98 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  34.04 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.82 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  36.52 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  34.59 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  38.19 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.74 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32.84 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.5 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  28.08 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.51 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  35.29 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  34.01 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  37.21 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.35 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  28.79 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  33.1 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  35.81 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  37.97 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34.51 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  32.89 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  32.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.81 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  33.66 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  31.36 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  28.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  30.36 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  30.34 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.88 
 
 		 317 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  29.45 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  32.14 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  30.66 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  37.21 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  26.57 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  31.4 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  27.7 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.66 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  29.63 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.92 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  27.46 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  32.5 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  30.38 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  29.05 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  26.89 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.01 
 
 		 318 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  31.03 
 
 		 297 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  28.95 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  25.35 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  30.65 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  35.56 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  30.34 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  29.27 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  32.91 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  35.37 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  29.27 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  34.82 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  32.98 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  28.99 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.89 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  28.68 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  26.27 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  27.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  35.09 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  26.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  32.86 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>