125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3737 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  100 
 
 		 272 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  62.07 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  62.07 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  62.07 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  60.98 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  60.98 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  54.95 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  59.76 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  59.76 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  55.91 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  55.91 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  39.75 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  58.33 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  39.9 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  37.97 
 
 		 287 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.96 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  37.12 
 
 		 212 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  57.14 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  55.95 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  53.85 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  52.27 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  47.56 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  48.81 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  47.62 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  47.62 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  45.24 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.26 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44.44 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  50 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.86 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  41.18 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.65 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  37.5 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.65 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.33 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.33 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.58 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  34.62 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  46.48 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.54 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  44.44 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  40.51 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  31.43 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  38.96 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  41.25 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.16 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  29.24 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  46.75 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  46.75 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  35.43 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  33.09 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.93 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40.24 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  40.3 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.24 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  42.03 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  36.9 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  31.03 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  43.48 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  28.67 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  26.58 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  31.15 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  34.18 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  42.62 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  26.23 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  32.1 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  41.82 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  42.86 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.82 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.5 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.47 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.33 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  44.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.53 
 
 		 206 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.2 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  40 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  26.41 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  30.64 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3346  TonB family protein  33.33 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.33 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.36 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.54 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  34.44 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  30.21 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  46 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  25.97 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  34.78 
 
 		 115 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.78 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  35.53 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  35.53 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  33.73 
 
 		 332 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  37.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  25.64 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  38.46 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  33.59 
 
 		 362 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  37.5 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2390  TonB family protein  34.44 
 
 		 474 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>