More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3735 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  74.66 
 
 		 146 aa  220  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  76.03 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  69.18 
 
 		 144 aa  204  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  68.49 
 
 		 144 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  67.81 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  67.12 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  66.44 
 
 		 145 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  65.75 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  55.48 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  54.79 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  53.42 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  54.11 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  51.72 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  51.72 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  52.45 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  51.75 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  51.75 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  53.79 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  53.79 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  55.17 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  50.35 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  51.75 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  52.74 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  50.35 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  50.34 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  52.41 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  53.12 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  51.72 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  52.05 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  51.75 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  48.28 
 
 		 163 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  46.9 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  50.68 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  49.32 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  46.21 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  43.84 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  46.72 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  45.39 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  45.45 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  44.83 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  44.22 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  44.29 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  53.92 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  38.57 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  41.55 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.11 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  41.35 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  40.15 
 
 		 182 aa  96.3  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  40 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.03 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.44 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.81 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  34.59 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  37.32 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.6 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  39.23 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  39.83 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  39.69 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.82 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  43.85 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  40.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  34.81 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  33.83 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  37.32 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  39.1 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.25 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  35.88 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.69 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  36.57 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  36.96 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  35.43 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  31.69 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>